U cilju pospešivanja razmene iskustava i uvećanja zajedničkog znanja i procesa učenja, partnerske opštine su osnovale (kad god su se zajedničke teme pojavile) međuopštinske tematske radne grupe. Ove grupe uključuju značajne opštinske stručnjake u tim oblastima i/ili odgovorne osobe sa svojim zadacima i funkcijama u svojim opštinama.

Sastav grupa, uslovi rada i trajanje zavisi od predmeta koji se u grupi obrađuje. Svaka radna grupa jasno definiše viziju, misiju, ciljeve, očekivane rezultate i aktivnosti. Grupe obezbeđuju aktivno i adekvatno informisanje i učešće predstavnika civilnog društva i privatnog sektora.

Opštine delegiraju svoje stručnjake iz ovih oblasti u međuopštinske radne grupe uz podršku Kancelarije za podršku programu.

Rezultati rada međuopštinskih radnih grupa su predstavljeni, u formi protokola sa sastanka, predstavnicima opština u Koordinacionom odboru i, od slučaja do slučaja, članovima Tima za promene.